14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0648 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0648  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  920    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1739  O-antigen polymerase  44 
 
 		 465 aa  327  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4472  hypothetical protein  33 
 
 		 509 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8491  O-antigen polymerase  34.84 
 
 		 469 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.867737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6554  O-antigen polymerase  35.68 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1927  O-antigen polymerase  31.3 
 
 		 679 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  33.88 
 
 		 489 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0753  O-antigen polymerase  32.47 
 
 		 476 aa  170  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409596  hitchhiker  0.000594246 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3905  O-antigen polymerase  31.55 
 
 		 456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4126  O-antigen polymerase  32.89 
 
 		 440 aa  159  9e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2697  O-antigen polymerase  29.59 
 
 		 419 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1072  hypothetical protein  29.22 
 
 		 457 aa  113  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0066  O-antigen polymerase  24.61 
 
 		 438 aa  98.2  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.059458  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  23.33 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>