59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3580 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  100 
 
 		 504 aa  969    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  71.67 
 
 		 503 aa  605  9.999999999999999e-173  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  44.69 
 
 		 496 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  41.11 
 
 		 474 aa  303  6.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  24.62 
 
 		 436 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  26.15 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  23.37 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  30.42 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  30.42 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  28.21 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  27.47 
 
 		 501 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  22.8 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  29.03 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  27.96 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  23.57 
 
 		 475 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  26.16 
 
 		 754 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  28.12 
 
 		 467 aa  53.5  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  27.92 
 
 		 436 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  27.98 
 
 		 671 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  23.88 
 
 		 509 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  25.49 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  26.94 
 
 		 437 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  26.27 
 
 		 480 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2333  O-antigen polymerase  25.38 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  27.54 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  23.68 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  26.99 
 
 		 438 aa  50.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  28.07 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  26.8 
 
 		 686 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  26.8 
 
 		 686 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  27.04 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  21.93 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  22.09 
 
 		 461 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  27.3 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4478  O-antigen polymerase  28.71 
 
 		 608 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  26.3 
 
 		 672 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  23.55 
 
 		 425 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  41.98 
 
 		 440 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  23.73 
 
 		 540 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  31.17 
 
 		 498 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  22.14 
 
 		 532 aa  47.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  29.41 
 
 		 773 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2653  O-antigen polymerase  26.38 
 
 		 499 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  26.05 
 
 		 424 aa  47  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05350  O-antigen polymerase, Wzy protein  27.87 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00185086  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  26.19 
 
 		 466 aa  46.6  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  25.61 
 
 		 494 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  29.79 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  22.68 
 
 		 470 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0134  hypothetical protein  23.38 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74095  normal  0.279508 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5482  hypothetical protein  26.67 
 
 		 545 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  27.18 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3180  O-antigen polymerase  32.34 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  23.76 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  28.64 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2346  O-antigen polymerase  25 
 
 		 1009 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0470801  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  25.56 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  25 
 
 		 512 aa  43.9  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>