36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2299 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  820    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  72.04 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  54.39 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  48.08 
 
 		 439 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.285408 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1310  hypothetical protein  46.88 
 
 		 439 aa  361  2e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18371  hypothetical protein  47.13 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13891  hypothetical protein  28.26 
 
 		 416 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13971  hypothetical protein  25.85 
 
 		 422 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  31.48 
 
 		 438 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1297  hypothetical protein  23.64 
 
 		 444 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289978  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  27.1 
 
 		 444 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0134  hypothetical protein  31.26 
 
 		 435 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74095  normal  0.279508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  31.08 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  27.95 
 
 		 418 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  28.37 
 
 		 418 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  37.58 
 
 		 480 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  27.91 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  26.71 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  29.27 
 
 		 467 aa  52.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  24.91 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  29.73 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  28.11 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  24.9 
 
 		 441 aa  50.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  37.78 
 
 		 565 aa  50.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  27.08 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  28.46 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  31.19 
 
 		 503 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  41.25 
 
 		 516 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  31.82 
 
 		 582 aa  47.8  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  26.67 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  39.71 
 
 		 517 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  39.71 
 
 		 517 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  32.93 
 
 		 531 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1029  putative O-antigen polymerase, putative membrane protein  24.81 
 
 		 455 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.384191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  27.03 
 
 		 489 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>