24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1297 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1297  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  865    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289978  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13971  hypothetical protein  36.49 
 
 		 422 aa  203  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13891  hypothetical protein  33.25 
 
 		 416 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  29.18 
 
 		 439 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.285408 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  28.15 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1310  hypothetical protein  28.76 
 
 		 439 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18371  hypothetical protein  27.65 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  23.64 
 
 		 424 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  24.11 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  28.24 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0134  hypothetical protein  26.13 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74095  normal  0.279508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  22.4 
 
 		 438 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  23.29 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  23.29 
 
 		 418 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  27.36 
 
 		 451 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  29.81 
 
 		 565 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0843  O-antigen polymerase  37.84 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  23.9 
 
 		 442 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  27.84 
 
 		 531 aa  47  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1029  putative O-antigen polymerase, putative membrane protein  23.47 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.384191  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  25.36 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1694  O-antigen polymerase  31.08 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000414796  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  27.41 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  22.1 
 
 		 503 aa  43.5  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>