39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2670 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  813    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  72.04 
 
 		 424 aa  585  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  55.53 
 
 		 437 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  45.99 
 
 		 439 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.285408 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1310  hypothetical protein  46.19 
 
 		 439 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18371  hypothetical protein  47.69 
 
 		 443 aa  331  1e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13891  hypothetical protein  29.98 
 
 		 416 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13971  hypothetical protein  25.59 
 
 		 422 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1297  hypothetical protein  24.58 
 
 		 444 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289978  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  28.2 
 
 		 444 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  28.95 
 
 		 438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  27.47 
 
 		 418 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0134  hypothetical protein  30.85 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74095  normal  0.279508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  27.25 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  29.94 
 
 		 442 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  32.28 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  28.69 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  28.28 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  29.47 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  28.46 
 
 		 430 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  29.81 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  33.54 
 
 		 565 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  29.61 
 
 		 438 aa  50.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  42.65 
 
 		 503 aa  50.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  40.91 
 
 		 516 aa  50.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  25.23 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  24.34 
 
 		 467 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  37.36 
 
 		 582 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  24.83 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  24.83 
 
 		 457 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  25 
 
 		 471 aa  48.5  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  41.43 
 
 		 517 aa  47.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  41.43 
 
 		 517 aa  47  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1029  putative O-antigen polymerase, putative membrane protein  28.19 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.384191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  37.68 
 
 		 531 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  36.78 
 
 		 556 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  24.66 
 
 		 509 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  40.85 
 
 		 504 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  23.42 
 
 		 470 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>