37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0304 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  100 
 
 		 451 aa  904    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  56.21 
 
 		 444 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  26.39 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  28.29 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  25.72 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  31.78 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  26.96 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  32 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  32.09 
 
 		 439 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  25.5 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  30.45 
 
 		 437 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1179  O-antigen polymerase  26.3 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  27.54 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  25.77 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  23.88 
 
 		 438 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  25.57 
 
 		 409 aa  53.9  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  24.3 
 
 		 434 aa  53.5  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  26.5 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  27.4 
 
 		 401 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  30.93 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  29.23 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  25.95 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  25.81 
 
 		 460 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  27.78 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  29.56 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  29.56 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  21.74 
 
 		 416 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  24.64 
 
 		 440 aa  47.4  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  27.08 
 
 		 517 aa  46.2  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  27.08 
 
 		 517 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  28.26 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1297  hypothetical protein  39.13 
 
 		 444 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289978  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  23.91 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  28.75 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  24.42 
 
 		 358 aa  43.9  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  25.44 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>