39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6232 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  100 
 
 		 441 aa  881    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  68.18 
 
 		 439 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  49.25 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  31.44 
 
 		 421 aa  140  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  28.83 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  29.9 
 
 		 467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  27.6 
 
 		 433 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  27.15 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  26.78 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  28.65 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  30.87 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  26.17 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  27.4 
 
 		 429 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  28.27 
 
 		 429 aa  90.9  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  28.43 
 
 		 409 aa  90.5  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 437 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  27.22 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  30.18 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  28.52 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  29.78 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  28.23 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  23.65 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  29.04 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  26.86 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  27.66 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  24.88 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  25.91 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  27.82 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1179  O-antigen polymerase  25.78 
 
 		 446 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  25.63 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  28.99 
 
 		 441 aa  57  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  29.17 
 
 		 448 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  25.96 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  29.55 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  26.85 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  35.29 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0658  O-antigen polymerase family protein  23.19 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.238334  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  28.26 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  26.75 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>