34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4801 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  100 
 
 
440 aa  887    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  33.01 
 
 
433 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  31.78 
 
 
429 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  31.78 
 
 
429 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  31.86 
 
 
444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  29.87 
 
 
428 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  28.21 
 
 
434 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  28.62 
 
 
425 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  29.43 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  23.85 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  23.75 
 
 
439 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  26.67 
 
 
417 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  26.16 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  29.21 
 
 
401 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  24.63 
 
 
444 aa  64.3  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  26.98 
 
 
433 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  22.71 
 
 
433 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  27.57 
 
 
438 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  25.18 
 
 
429 aa  54.3  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  25.95 
 
 
451 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  31.58 
 
 
358 aa  50.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  27 
 
 
448 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  29.33 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  23.75 
 
 
440 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  32.05 
 
 
313 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  29.01 
 
 
440 aa  47.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  30.89 
 
 
453 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  25.51 
 
 
442 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  25.29 
 
 
421 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  25 
 
 
437 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  23.17 
 
 
501 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  29.03 
 
 
467 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  27 
 
 
409 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  30.21 
 
 
460 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>