37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0892 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  100 
 
 		 428 aa  853    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  27.5 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  28.69 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  27.97 
 
 		 421 aa  107  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  26.78 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  28.77 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  28.01 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  26.63 
 
 		 409 aa  96.7  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  26.87 
 
 		 437 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  26.9 
 
 		 419 aa  89.7  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  29.33 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  25.57 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  29.61 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1179  O-antigen polymerase  30.18 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  25.23 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  27.85 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  24.89 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  27.48 
 
 		 460 aa  67  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  23.79 
 
 		 441 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  24.01 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  25.97 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  25.89 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  23.04 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  23.2 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  24.14 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  24.14 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  32.23 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  24.75 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  23.24 
 
 		 401 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  21.67 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4136  hypothetical protein  29.57 
 
 		 611 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.2496 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  32.18 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0287  O-antigen polymerase  28.7 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  28.27 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  25.54 
 
 		 425 aa  43.9  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>