29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0257 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  100 
 
 		 453 aa  890    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  37.47 
 
 		 440 aa  257  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  36.45 
 
 		 443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  36.6 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  34.3 
 
 		 358 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  31.96 
 
 		 436 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  31.87 
 
 		 441 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  31.94 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  30.19 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  32.29 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  28.46 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  26.55 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  23.54 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  29.08 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  34.95 
 
 		 448 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  23.05 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  30 
 
 		 438 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  27.69 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  26.8 
 
 		 401 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  28.22 
 
 		 429 aa  50.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  28.22 
 
 		 429 aa  50.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  26.71 
 
 		 460 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  27.98 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  31.31 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  24.62 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  31.37 
 
 		 425 aa  47.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  30.14 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  31.71 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  33.85 
 
 		 417 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>