50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1380 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  100 
 
 		 313 aa  630  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  37.02 
 
 		 433 aa  163  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  31.96 
 
 		 438 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  27.7 
 
 		 409 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  28.21 
 
 		 421 aa  94.4  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  29.61 
 
 		 428 aa  93.2  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  27.87 
 
 		 433 aa  90.1  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  26.84 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  25.19 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  28.02 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  25.77 
 
 		 451 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  30.15 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  27.75 
 
 		 453 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  28.79 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  27.23 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  26.81 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  25.22 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  28.87 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1179  O-antigen polymerase  29.39 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  29.03 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  29.46 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  27.51 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  25.12 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  26.92 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  30 
 
 		 442 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  23.4 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  23.14 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  23.93 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  23.74 
 
 		 433 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  31.01 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  22.83 
 
 		 437 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2346  O-antigen polymerase  26.11 
 
 		 481 aa  52.8  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  23.88 
 
 		 425 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  29.19 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  29.19 
 
 		 404 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  29.63 
 
 		 440 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  32.58 
 
 		 448 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1801  hypothetical protein  25.37 
 
 		 480 aa  50.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  24.38 
 
 		 429 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  24.38 
 
 		 429 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  32.05 
 
 		 440 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  25.61 
 
 		 404 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  28.57 
 
 		 404 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  28.57 
 
 		 404 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  28.57 
 
 		 404 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2886  O-antigen ligase-like  24.04 
 
 		 414 aa  47  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000199013  normal  0.062273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  26.35 
 
 		 444 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  23.74 
 
 		 416 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0270  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 425 aa  44.3  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.143785  normal  0.425516 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0634  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 415 aa  42.4  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.60095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>