42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6427 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  100 
 
 		 439 aa  871    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  68.18 
 
 		 441 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  47.09 
 
 		 417 aa  335  9e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  28.5 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  30.4 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  29.38 
 
 		 421 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  29.29 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  30 
 
 		 438 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  28.39 
 
 		 409 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  26.87 
 
 		 467 aa  106  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  27.73 
 
 		 428 aa  103  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  30.71 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  27.4 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  28.1 
 
 		 416 aa  93.2  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  26.27 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  26.27 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  28.09 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  29.82 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  23.17 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  26.72 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  28.37 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1179  O-antigen polymerase  27.62 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  26.61 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  26 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  27.12 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  26.69 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  32.09 
 
 		 451 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  27.36 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  28.83 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  26.35 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  30.48 
 
 		 436 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  29.64 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  31.52 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  27.88 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  30.14 
 
 		 440 aa  57  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  28.47 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 540 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  27.14 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  28.22 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  26.54 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4235  O-antigen polymerase  29.21 
 
 		 474 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000407687  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 448 aa  43.5  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>