36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1179 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1179  O-antigen polymerase  100 
 
 		 446 aa  889    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  29.67 
 
 		 433 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  28.07 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  28.76 
 
 		 421 aa  134  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  28.81 
 
 		 438 aa  133  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  30.85 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  29.25 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  28.53 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  29.59 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  30.07 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  27.22 
 
 		 444 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  26.33 
 
 		 451 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  27.2 
 
 		 313 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  26.61 
 
 		 441 aa  86.3  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  28.43 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  25.63 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  24.34 
 
 		 416 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  27.27 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  25.45 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  30 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  27.47 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  26.43 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  32.11 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  28.34 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  28.87 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  26.65 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  27.43 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  28.34 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  27.73 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  26.3 
 
 		 425 aa  53.9  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  26.64 
 
 		 358 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  25.95 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  24.42 
 
 		 444 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  32.05 
 
 		 448 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>