31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1091 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  100 
 
 		 429 aa  853    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  29.74 
 
 		 437 aa  176  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  31.64 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  30 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  29.37 
 
 		 417 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  28.36 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  27.54 
 
 		 467 aa  77.4  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  28.24 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  30.26 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  24.94 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  26.87 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  24.54 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  24.25 
 
 		 428 aa  67  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  25.71 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  28.37 
 
 		 444 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  23.01 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  23.99 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  23.86 
 
 		 438 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  26.01 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  23.45 
 
 		 434 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  32 
 
 		 453 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  23.14 
 
 		 313 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  24.85 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1179  O-antigen polymerase  25.08 
 
 		 446 aa  48.5  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  31.18 
 
 		 358 aa  48.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  34.57 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  29.17 
 
 		 440 aa  47.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  23.91 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  24.14 
 
 		 429 aa  46.6  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  21.94 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  28.25 
 
 		 428 aa  43.9  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>