36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4237 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  100 
 
 		 429 aa  850    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  71.33 
 
 		 441 aa  606  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  32.78 
 
 		 440 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  32.76 
 
 		 443 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  31.94 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  29.81 
 
 		 436 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  32.99 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  30.88 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  25.37 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  24.83 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  26.51 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  30.86 
 
 		 417 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  26.69 
 
 		 439 aa  67  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  24.72 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  24.33 
 
 		 460 aa  66.2  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  25.59 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  29.93 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  25.28 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  29.85 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  27.61 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  27.18 
 
 		 438 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  28.06 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  32.76 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  28.06 
 
 		 429 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  26.6 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  24.55 
 
 		 451 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  27.72 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  36.11 
 
 		 313 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  26.72 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  32.5 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  30.48 
 
 		 517 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  24.83 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  30.48 
 
 		 517 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  34.62 
 
 		 448 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  26.37 
 
 		 440 aa  46.6  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  27.16 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>