34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3184 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  100 
 
 		 442 aa  884    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  80.09 
 
 		 440 aa  672    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  34.24 
 
 		 460 aa  223  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  27.67 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  27.05 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  26.97 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  24.92 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  27.01 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  27.72 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  27.06 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  36.47 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 444 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  27.38 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  26.79 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  27.45 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  25.29 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  25.6 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  26.61 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  30.2 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  28.5 
 
 		 421 aa  59.7  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  29.83 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  25.8 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  27.2 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  26.6 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  25.65 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  25.55 
 
 		 453 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  25.63 
 
 		 440 aa  53.5  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  26.84 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  26.84 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  28.08 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  35.14 
 
 		 448 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  29.95 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  30.92 
 
 		 443 aa  47  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  24.01 
 
 		 429 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>