40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3696 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  100 
 
 		 417 aa  806    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  49.25 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  47.09 
 
 		 439 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  32.52 
 
 		 421 aa  136  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  28.79 
 
 		 433 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  33.98 
 
 		 419 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  29.61 
 
 		 438 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  31.77 
 
 		 467 aa  112  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  29.49 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  30.5 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  27.11 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  29.58 
 
 		 428 aa  99.8  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  29.48 
 
 		 460 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  31 
 
 		 425 aa  97.1  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  30.02 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  26.74 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  28.84 
 
 		 433 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  27.47 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  27.47 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1179  O-antigen polymerase  28.73 
 
 		 446 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  29.35 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  30.29 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  27.15 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  25.75 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  26.01 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  29.11 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  32.55 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  32.51 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  28.57 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  29.72 
 
 		 429 aa  67  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  40.57 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  33.53 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  29.25 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  26.43 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  28.66 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  28.18 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  27.93 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  26.85 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  34.57 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0249  O-antigen polymerase  25.27 
 
 		 492 aa  43.9  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>