31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0810 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  100 
 
 		 441 aa  862    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  36.5 
 
 		 453 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  35.37 
 
 		 443 aa  211  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  36.39 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  38.68 
 
 		 436 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  32.12 
 
 		 358 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  29.31 
 
 		 441 aa  140  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  31.78 
 
 		 429 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  31.65 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  29.57 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  24.67 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  33.21 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  27.34 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  27.16 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  30.8 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  29.26 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  29.74 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  23.41 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  29.17 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  27.54 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  27.98 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  25.85 
 
 		 313 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  27.23 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1179  O-antigen polymerase  27.6 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  26.94 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  26.94 
 
 		 429 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  26.37 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  28.68 
 
 		 401 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  28.41 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  25.63 
 
 		 434 aa  43.5  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  36.99 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>