33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4530 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  100 
 
 		 444 aa  872    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  33.04 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  30.56 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  31.86 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  30.48 
 
 		 429 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  30.48 
 
 		 429 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  30.92 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  30.56 
 
 		 425 aa  89.7  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  27.03 
 
 		 439 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1091  exopolysaccharide production protein  28.32 
 
 		 429 aa  67  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.802391  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  26.25 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  30 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  27.58 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  24.26 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  25.89 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  35.71 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  27.3 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5482  hypothetical protein  34 
 
 		 545 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  27.13 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  30.04 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  26.64 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  26.5 
 
 		 451 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  26.62 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  25.56 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  22.29 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  30.23 
 
 		 358 aa  47.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  23.58 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  25.67 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  27.19 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  31.25 
 
 		 313 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  30.68 
 
 		 443 aa  43.1  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0634  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 415 aa  43.1  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.60095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>