57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4672 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  100 
 
 		 503 aa  1003    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  56.34 
 
 		 506 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  58.55 
 
 		 516 aa  457  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  46.47 
 
 		 565 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  49.56 
 
 		 582 aa  343  4e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  44.3 
 
 		 556 aa  324  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  43.21 
 
 		 517 aa  303  7.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  44.29 
 
 		 517 aa  300  5e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  34.39 
 
 		 531 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  29.36 
 
 		 605 aa  103  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  30.8 
 
 		 560 aa  97.4  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  32.14 
 
 		 594 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  33.97 
 
 		 607 aa  95.1  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  30.16 
 
 		 595 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  26.87 
 
 		 569 aa  90.1  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  26.58 
 
 		 592 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  26.58 
 
 		 592 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  26.89 
 
 		 592 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  26.58 
 
 		 592 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  25.55 
 
 		 592 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  24.95 
 
 		 661 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  25.05 
 
 		 595 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  25.05 
 
 		 595 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  25.05 
 
 		 595 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  25.05 
 
 		 595 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  25.05 
 
 		 595 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  25.05 
 
 		 595 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  26.44 
 
 		 592 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  25.7 
 
 		 595 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  25.22 
 
 		 593 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  27.54 
 
 		 556 aa  73.2  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  25 
 
 		 590 aa  70.1  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  25.24 
 
 		 578 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  25.57 
 
 		 594 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  23.52 
 
 		 594 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  24.58 
 
 		 589 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  28.03 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  24.5 
 
 		 586 aa  57  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  42.05 
 
 		 437 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  26.16 
 
 		 596 aa  53.9  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  21.51 
 
 		 773 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  29.46 
 
 		 544 aa  50.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1029  putative O-antigen polymerase, putative membrane protein  28.03 
 
 		 455 aa  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.384191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  23.97 
 
 		 561 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  31.64 
 
 		 415 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  27.13 
 
 		 754 aa  49.3  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  31.19 
 
 		 424 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  32.84 
 
 		 438 aa  47.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  32.43 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  24.14 
 
 		 594 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  25.68 
 
 		 597 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  40.98 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  28.47 
 
 		 451 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  31.82 
 
 		 436 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  32.97 
 
 		 430 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  24.44 
 
 		 489 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18371  hypothetical protein  40.54 
 
 		 443 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>