53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3942 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  100 
 
 		 506 aa  1004    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  55.84 
 
 		 503 aa  462  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  51.96 
 
 		 516 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  45.08 
 
 		 582 aa  341  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  46.29 
 
 		 565 aa  340  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  41.34 
 
 		 556 aa  325  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  44.67 
 
 		 517 aa  309  8e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  44.44 
 
 		 517 aa  306  7e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  32.25 
 
 		 531 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  35.07 
 
 		 560 aa  99.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  28.47 
 
 		 605 aa  96.3  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  30.77 
 
 		 594 aa  92.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  28.54 
 
 		 595 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  28.66 
 
 		 607 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  22.67 
 
 		 590 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  22.39 
 
 		 592 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  22.39 
 
 		 592 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  22.39 
 
 		 592 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  23.19 
 
 		 592 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  23.44 
 
 		 589 aa  63.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  26.63 
 
 		 594 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  26.13 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  26.25 
 
 		 594 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  25.31 
 
 		 595 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  23.39 
 
 		 578 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  25.32 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  25.21 
 
 		 569 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  25.97 
 
 		 594 aa  56.6  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  22.88 
 
 		 661 aa  53.5  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  23.09 
 
 		 595 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  23.09 
 
 		 595 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  23.36 
 
 		 592 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  23.09 
 
 		 595 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  23.09 
 
 		 595 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  23.09 
 
 		 595 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  23.09 
 
 		 595 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  21.75 
 
 		 593 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  24.68 
 
 		 556 aa  51.6  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  28.11 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  30 
 
 		 544 aa  50.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  32.46 
 
 		 430 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  42.86 
 
 		 437 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  23.54 
 
 		 592 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  29.31 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  30.96 
 
 		 555 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  24.86 
 
 		 754 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  28.62 
 
 		 512 aa  45.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4985  O-antigen polymerase  27.94 
 
 		 391 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4936  O-antigen polymerase  30.88 
 
 		 391 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4808  O-antigen polymerase  30.15 
 
 		 391 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  23.89 
 
 		 586 aa  43.9  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  24.1 
 
 		 596 aa  43.9  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  36.84 
 
 		 415 aa  43.5  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>