18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4936 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4936  O-antigen polymerase  100 
 
 		 391 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4808  O-antigen polymerase  98.72 
 
 		 391 aa  754    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4985  O-antigen polymerase  91.05 
 
 		 391 aa  644    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66100  hypothetical protein  30 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5734  hypothetical protein  29.55 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1418  O-antigen polymerase  31.65 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0959818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  28.37 
 
 		 620 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0168  O-antigen polymerase  25.57 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  27.16 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44730  O-antigen polymerase protein  26.32 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0534  hypothetical protein  27.2 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  24.48 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  39.39 
 
 		 605 aa  44.3  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  36.99 
 
 		 582 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  38.57 
 
 		 531 aa  43.1  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  31.11 
 
 		 506 aa  43.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  24.66 
 
 		 433 aa  43.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4986  hypothetical protein  26.19 
 
 		 391 aa  42.7  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>