55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4678 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  100 
 
 		 544 aa  1069    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  35.97 
 
 		 597 aa  256  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  32.85 
 
 		 561 aa  233  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  32.06 
 
 		 594 aa  231  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0446  O-antigen polymerase  28.52 
 
 		 585 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4715  O-antigen polymerase  32.97 
 
 		 545 aa  179  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  28.86 
 
 		 579 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0410  O-antigen polymerase  29.8 
 
 		 552 aa  155  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0423  O-antigen polymerase  26.81 
 
 		 557 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  28.37 
 
 		 506 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  28 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  27.79 
 
 		 661 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  30.48 
 
 		 594 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  27.79 
 
 		 595 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  27.79 
 
 		 595 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  27.79 
 
 		 595 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  27.79 
 
 		 595 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  27.79 
 
 		 595 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  27.79 
 
 		 595 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  30 
 
 		 592 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  30 
 
 		 592 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  30 
 
 		 592 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2436  O-antigen polymerase  36.02 
 
 		 894 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  27.19 
 
 		 607 aa  54.7  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  31.07 
 
 		 582 aa  54.3  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  29.84 
 
 		 595 aa  54.3  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  43.06 
 
 		 430 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 426 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  29.46 
 
 		 592 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  29.32 
 
 		 593 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  27.99 
 
 		 531 aa  48.5  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  26.91 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  26.91 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  25.65 
 
 		 560 aa  48.9  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  27.87 
 
 		 556 aa  47.8  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  29.13 
 
 		 438 aa  47.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0134  hypothetical protein  33.33 
 
 		 435 aa  47.4  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74095  normal  0.279508 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  26.46 
 
 		 594 aa  47.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  26.26 
 
 		 517 aa  47.4  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  26.46 
 
 		 426 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  26.26 
 
 		 517 aa  47  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  25.9 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  25.9 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  25.9 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  29.7 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  25.27 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  27.47 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  26.85 
 
 		 594 aa  45.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  29.52 
 
 		 448 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  23.6 
 
 		 436 aa  44.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  34.11 
 
 		 620 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  26.67 
 
 		 556 aa  43.9  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  26.46 
 
 		 433 aa  43.5  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  27.68 
 
 		 435 aa  43.5  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  32.12 
 
 		 516 aa  43.5  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>