60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0650 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  95.05 
 
 
595 aa  1083    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  63.59 
 
 
594 aa  752    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  64.29 
 
 
596 aa  739    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  77.68 
 
 
592 aa  786    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  77.19 
 
 
592 aa  863    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  78.89 
 
 
593 aa  812    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  95.05 
 
 
595 aa  1083    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  94.88 
 
 
595 aa  1082    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  94.88 
 
 
595 aa  1082    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  95.05 
 
 
595 aa  1083    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  95.05 
 
 
595 aa  1083    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  76.84 
 
 
592 aa  860    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  78.03 
 
 
592 aa  793    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  76.84 
 
 
592 aa  860    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  94.71 
 
 
661 aa  1075    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  64.43 
 
 
594 aa  771    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  77.85 
 
 
592 aa  832    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  100 
 
 
595 aa  1178    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  33.21 
 
 
589 aa  250  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  32.76 
 
 
569 aa  226  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  30.94 
 
 
590 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  30.57 
 
 
607 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  31.38 
 
 
578 aa  186  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  29.73 
 
 
595 aa  174  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  29.83 
 
 
531 aa  107  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  27.49 
 
 
565 aa  95.1  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  25.21 
 
 
594 aa  90.1  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  25.62 
 
 
556 aa  87.8  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  27.27 
 
 
560 aa  85.9  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  25.28 
 
 
503 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  25.26 
 
 
555 aa  70.9  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  27.54 
 
 
556 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  27.27 
 
 
605 aa  55.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  30.36 
 
 
717 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  35.71 
 
 
440 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  26.01 
 
 
506 aa  52  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  20.62 
 
 
586 aa  50.8  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  24.37 
 
 
597 aa  50.4  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  27.78 
 
 
457 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  25.19 
 
 
428 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  27.78 
 
 
457 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  24.63 
 
 
410 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  29.13 
 
 
437 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  30.58 
 
 
413 aa  47.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0249  O-antigen polymerase  27.02 
 
 
492 aa  47.4  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  28.72 
 
 
517 aa  47  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  18.65 
 
 
773 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  26.32 
 
 
582 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02935  hypothetical protein  20.54 
 
 
408 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  29.59 
 
 
671 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  25.97 
 
 
594 aa  45.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  28.5 
 
 
393 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  27.27 
 
 
467 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  30.18 
 
 
426 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3838  hypothetical protein  30.43 
 
 
436 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.44323  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  19.83 
 
 
467 aa  44.3  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  30.43 
 
 
612 aa  43.9  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  31.65 
 
 
501 aa  43.9  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  27.75 
 
 
579 aa  43.9  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0271  O-antigen polymerase  26.54 
 
 
760 aa  43.5  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>