52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2692 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  63.8 
 
 		 594 aa  751    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  77.02 
 
 		 595 aa  870    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  76.84 
 
 		 595 aa  870    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  77.02 
 
 		 595 aa  872    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  77.02 
 
 		 595 aa  870    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  77.02 
 
 		 595 aa  870    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  88.08 
 
 		 593 aa  907    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  90.71 
 
 		 592 aa  1001    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  98.82 
 
 		 592 aa  1149    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  90.71 
 
 		 592 aa  999    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  64.46 
 
 		 596 aa  731    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  100 
 
 		 592 aa  1163    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  90.71 
 
 		 592 aa  999    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  64.14 
 
 		 594 aa  768    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  77.53 
 
 		 595 aa  865    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  91.71 
 
 		 592 aa  973    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  76.84 
 
 		 661 aa  864    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  77.02 
 
 		 595 aa  870    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  33.62 
 
 		 589 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  32.22 
 
 		 569 aa  229  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  33.1 
 
 		 590 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  30.27 
 
 		 607 aa  196  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  31.88 
 
 		 578 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  29.83 
 
 		 595 aa  180  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  28.84 
 
 		 531 aa  97.8  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  26.83 
 
 		 565 aa  97.1  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  27.16 
 
 		 560 aa  88.6  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  27.88 
 
 		 503 aa  88.6  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  27.25 
 
 		 594 aa  87.4  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  25.76 
 
 		 556 aa  86.3  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  25.99 
 
 		 555 aa  68.2  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  25.26 
 
 		 556 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  28.74 
 
 		 605 aa  58.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  20.81 
 
 		 586 aa  57  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  23.24 
 
 		 506 aa  53.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  34.57 
 
 		 440 aa  51.6  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  25.59 
 
 		 594 aa  51.2  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  26.36 
 
 		 425 aa  50.4  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  24.06 
 
 		 582 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0657  O-antigen polymerase  24.77 
 
 		 588 aa  49.3  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0056678  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0249  O-antigen polymerase  34.4 
 
 		 492 aa  47.8  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  23.81 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  23.15 
 
 		 597 aa  45.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  26.89 
 
 		 672 aa  44.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  24.53 
 
 		 436 aa  44.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  26.42 
 
 		 579 aa  44.3  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  27.88 
 
 		 501 aa  43.9  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2461  O-antigen polymerase  27.36 
 
 		 580 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  27.63 
 
 		 415 aa  43.9  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  27.63 
 
 		 717 aa  43.9  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  28.49 
 
 		 426 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  28.49 
 
 		 426 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>