15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2461 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2461  O-antigen polymerase  100 
 
 
580 aa  1180    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4136  hypothetical protein  24.39 
 
 
611 aa  130  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.2496 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  26.36 
 
 
579 aa  67.4  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  24.05 
 
 
597 aa  57.8  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  24.92 
 
 
561 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  24.75 
 
 
594 aa  48.9  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  24.17 
 
 
393 aa  48.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0410  O-antigen polymerase  23.77 
 
 
552 aa  47.4  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  23.11 
 
 
737 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  26.97 
 
 
402 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  28.81 
 
 
512 aa  45.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  27.89 
 
 
593 aa  45.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  20.21 
 
 
870 aa  44.7  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  24.57 
 
 
471 aa  44.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  24.79 
 
 
754 aa  43.5  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>