50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0466 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  60.95 
 
 		 569 aa  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  100 
 
 		 589 aa  1171    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  59.05 
 
 		 590 aa  680    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  56.77 
 
 		 578 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  32.5 
 
 		 594 aa  256  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  32.82 
 
 		 594 aa  250  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  33.56 
 
 		 592 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  33.56 
 
 		 592 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  33.56 
 
 		 592 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  34.43 
 
 		 596 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  33.27 
 
 		 595 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  33.52 
 
 		 661 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  33.76 
 
 		 595 aa  241  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  33.76 
 
 		 595 aa  241  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  33.76 
 
 		 595 aa  241  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  33.76 
 
 		 595 aa  241  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  33.76 
 
 		 595 aa  241  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  33.58 
 
 		 595 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  33.1 
 
 		 592 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  33.57 
 
 		 593 aa  230  7e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  32.94 
 
 		 592 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  32.76 
 
 		 592 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  31.56 
 
 		 607 aa  207  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  29.67 
 
 		 595 aa  187  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  35.14 
 
 		 531 aa  95.9  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  30.3 
 
 		 594 aa  92  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  24.59 
 
 		 556 aa  83.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  25.16 
 
 		 565 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 555 aa  77  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  31.32 
 
 		 560 aa  70.9  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  26.49 
 
 		 582 aa  69.3  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  26.42 
 
 		 517 aa  68.2  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  26.24 
 
 		 556 aa  68.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  25.47 
 
 		 517 aa  62  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  33.87 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  23.63 
 
 		 506 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  28.77 
 
 		 605 aa  58.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  35.29 
 
 		 686 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  35.29 
 
 		 686 aa  55.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  23.48 
 
 		 579 aa  53.9  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  29.41 
 
 		 459 aa  51.2  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0446  O-antigen polymerase  24.41 
 
 		 585 aa  51.2  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2494  O-antigen polymerase  25.4 
 
 		 563 aa  50.8  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.754605 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  23.05 
 
 		 586 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  30.67 
 
 		 717 aa  48.9  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  21.92 
 
 		 773 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  25.63 
 
 		 594 aa  47.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  29.56 
 
 		 612 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  31.31 
 
 		 672 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  39.47 
 
 		 459 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>