50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0448 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  64.68 
 
 		 595 aa  767    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  77.78 
 
 		 594 aa  931    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  100 
 
 		 596 aa  1201    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  65.29 
 
 		 592 aa  680    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  64.73 
 
 		 592 aa  736    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  64.26 
 
 		 593 aa  682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  64.68 
 
 		 595 aa  767    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  64.68 
 
 		 595 aa  768    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  64.68 
 
 		 595 aa  768    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  64.68 
 
 		 595 aa  767    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  64.68 
 
 		 595 aa  767    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  64.73 
 
 		 592 aa  737    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  64.95 
 
 		 592 aa  680    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  64.73 
 
 		 592 aa  737    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  79.97 
 
 		 594 aa  962    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  64.51 
 
 		 661 aa  760    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  65.46 
 
 		 592 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  64.16 
 
 		 595 aa  755    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  33.81 
 
 		 589 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  32.22 
 
 		 569 aa  226  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  32.14 
 
 		 590 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  30.78 
 
 		 607 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  31.1 
 
 		 578 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  29.67 
 
 		 595 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  27.41 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  25.46 
 
 		 560 aa  80.9  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  24.02 
 
 		 594 aa  73.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  25.83 
 
 		 556 aa  72  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  23.2 
 
 		 586 aa  68.2  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  24.52 
 
 		 565 aa  67.8  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  25.77 
 
 		 555 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  28.99 
 
 		 717 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  25.12 
 
 		 605 aa  50.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  26.07 
 
 		 503 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  27.74 
 
 		 516 aa  48.5  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  26.87 
 
 		 496 aa  47.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0657  O-antigen polymerase  24.55 
 
 		 588 aa  47.4  0.0009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0056678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  31.17 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  23.17 
 
 		 773 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  22.59 
 
 		 612 aa  45.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  27.5 
 
 		 556 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  23.86 
 
 		 506 aa  45.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  28.57 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  27.17 
 
 		 671 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  36.07 
 
 		 440 aa  44.7  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  29.63 
 
 		 425 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  27.5 
 
 		 512 aa  44.3  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  27.52 
 
 		 457 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  27.85 
 
 		 415 aa  43.9  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  27.52 
 
 		 457 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>