48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0479 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  61.71 
 
 		 569 aa  708    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  100 
 
 		 578 aa  1160    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  56.79 
 
 		 589 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  55.81 
 
 		 590 aa  611  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  32.58 
 
 		 594 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  31.69 
 
 		 594 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  30.65 
 
 		 595 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  30.47 
 
 		 595 aa  203  9e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  30.47 
 
 		 595 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  30.47 
 
 		 595 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  30.47 
 
 		 595 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  30.47 
 
 		 595 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  30.58 
 
 		 661 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  30.97 
 
 		 595 aa  197  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  29.97 
 
 		 592 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  29.96 
 
 		 592 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  29.96 
 
 		 592 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  31.59 
 
 		 607 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  30.73 
 
 		 596 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  31.25 
 
 		 593 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  30.46 
 
 		 592 aa  183  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  31 
 
 		 592 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  30.82 
 
 		 592 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  28.99 
 
 		 595 aa  164  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  27.93 
 
 		 531 aa  90.1  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  27.42 
 
 		 594 aa  89.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  25 
 
 		 565 aa  87.8  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  27.31 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  28.4 
 
 		 579 aa  81.6  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  26.59 
 
 		 560 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  25.32 
 
 		 503 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  24.64 
 
 		 556 aa  74.3  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  24.58 
 
 		 506 aa  73.9  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  26.18 
 
 		 555 aa  67  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  26.37 
 
 		 582 aa  63.9  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  27.05 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  23.35 
 
 		 586 aa  58.9  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  26.96 
 
 		 517 aa  54.7  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  26.91 
 
 		 516 aa  54.3  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  31.25 
 
 		 717 aa  51.2  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  28.62 
 
 		 605 aa  49.7  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0969  O-antigen polymerase  26.63 
 
 		 446 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.948168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  32.85 
 
 		 686 aa  47.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  32.85 
 
 		 686 aa  47.4  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  27.65 
 
 		 612 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  30.63 
 
 		 544 aa  46.2  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  24.66 
 
 		 594 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  24.48 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>