30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0242 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  100 
 
 
586 aa  1181    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  24.24 
 
 
590 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  21.02 
 
 
569 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  25.67 
 
 
607 aa  61.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  20.61 
 
 
594 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  21.62 
 
 
592 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  20.09 
 
 
594 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  21.62 
 
 
592 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  21.62 
 
 
592 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  23.74 
 
 
560 aa  55.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  22.74 
 
 
596 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  24.19 
 
 
531 aa  54.3  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  23.05 
 
 
589 aa  49.7  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  21.1 
 
 
593 aa  49.7  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  23.47 
 
 
595 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  21.78 
 
 
592 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  20.85 
 
 
595 aa  47.4  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  25.33 
 
 
595 aa  47.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  27.16 
 
 
773 aa  47.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  25.33 
 
 
595 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  25.33 
 
 
595 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  25.33 
 
 
595 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  25.33 
 
 
595 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  24.1 
 
 
503 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  25.33 
 
 
661 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  25.33 
 
 
595 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  33.33 
 
 
467 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  23.35 
 
 
578 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  27.46 
 
 
612 aa  44.7  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  37.68 
 
 
503 aa  43.5  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>