99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2194 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  100 
 
 		 582 aa  1146    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  52.1 
 
 		 556 aa  403  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  54.92 
 
 		 517 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  55.5 
 
 		 517 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  45.99 
 
 		 506 aa  354  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  49.32 
 
 		 503 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  44.79 
 
 		 565 aa  313  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  43.87 
 
 		 516 aa  273  6e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  31.83 
 
 		 531 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4318  hypothetical protein  93.1 
 
 		 143 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.385835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  73.68 
 
 		 2200 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4441  hypothetical protein  53.33 
 
 		 385 aa  101  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  31.65 
 
 		 605 aa  98.6  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4622  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  83.33 
 
 		 277 aa  98.2  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  73.53 
 
 		 514 aa  97.8  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  67.86 
 
 		 3275 aa  97.4  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2000  hypothetical protein  76.92 
 
 		 167 aa  97.1  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0193  hypothetical protein  85.96 
 
 		 121 aa  96.3  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.092331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2545  hypothetical protein  85.96 
 
 		 514 aa  96.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4204  hypothetical protein  44.32 
 
 		 394 aa  96.3  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4746  hypothetical protein  54.72 
 
 		 173 aa  95.9  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2536  beta-ketoacyl synthase  83.93 
 
 		 522 aa  94.7  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1024  hypothetical protein  84.21 
 
 		 172 aa  94  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3586  hypothetical protein  84.21 
 
 		 104 aa  93.6  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  64.71 
 
 		 336 aa  93.6  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3276  hypothetical protein  78.46 
 
 		 172 aa  91.3  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1283  transposase, IS4 family protein  83.93 
 
 		 304 aa  90.5  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4003  hypothetical protein  66.67 
 
 		 100 aa  90.1  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313951  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1699  hypothetical protein  73.53 
 
 		 105 aa  89.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4615  hypothetical protein  83.33 
 
 		 112 aa  87.4  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0565209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  81.48 
 
 		 305 aa  85.5  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  25.33 
 
 		 589 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2035  hypothetical protein  78.18 
 
 		 192 aa  79.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  30.14 
 
 		 594 aa  78.2  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  29.28 
 
 		 560 aa  77  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  29.15 
 
 		 607 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  27.38 
 
 		 590 aa  73.9  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0467  hypothetical protein  56.94 
 
 		 132 aa  69.3  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0763  hypothetical protein  87.18 
 
 		 149 aa  67  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2030  hypothetical protein  70.37 
 
 		 109 aa  66.6  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  27.55 
 
 		 569 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3511  hypothetical protein  87.18 
 
 		 98 aa  66.2  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325201  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  27.25 
 
 		 578 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2056  hypothetical protein  84.62 
 
 		 156 aa  65.5  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3787  hypothetical protein  85 
 
 		 135 aa  65.1  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.564529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1094  hypothetical protein  87.18 
 
 		 97 aa  65.1  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0968333 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1997  hypothetical protein  87.18 
 
 		 79 aa  64.7  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.570421 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  26.18 
 
 		 595 aa  64.3  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1020  hypothetical protein  87.18 
 
 		 88 aa  63.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1701  hypothetical protein  72.73 
 
 		 102 aa  62.4  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4768  hypothetical protein  86.11 
 
 		 105 aa  60.1  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1161  hypothetical protein  84.21 
 
 		 95 aa  59.3  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  25.08 
 
 		 593 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  32.42 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  26.05 
 
 		 592 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  26.05 
 
 		 592 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  26.05 
 
 		 592 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  25.54 
 
 		 556 aa  57  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  22.35 
 
 		 586 aa  55.8  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  22.88 
 
 		 597 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  24.53 
 
 		 661 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 592 aa  55.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3061  hypothetical protein  74.29 
 
 		 111 aa  55.5  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.341918  normal  0.0301074 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  24.53 
 
 		 595 aa  54.7  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1790  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  89.66 
 
 		 563 aa  54.3  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  24.53 
 
 		 595 aa  53.9  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  24.53 
 
 		 595 aa  53.9  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  24.53 
 
 		 595 aa  53.9  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  24.53 
 
 		 595 aa  53.9  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4493  extracellular solute-binding protein  89.29 
 
 		 577 aa  53.5  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  21.58 
 
 		 594 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1525  hypothetical protein  89.29 
 
 		 125 aa  53.5  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4508  hypothetical protein  96.3 
 
 		 95 aa  53.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.619373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  24.92 
 
 		 595 aa  52.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1330  hypothetical protein  92.59 
 
 		 142 aa  52.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24136  hitchhiker  0.00281182 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  24.02 
 
 		 592 aa  51.6  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  92.59 
 
 		 209 aa  51.6  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0363  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  51.2  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  24.02 
 
 		 592 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2997  hypothetical protein  75 
 
 		 156 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0932717  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  38.3 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  21.54 
 
 		 561 aa  48.9  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  25.91 
 
 		 595 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  28.53 
 
 		 555 aa  47.8  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2342  hypothetical protein  72.73 
 
 		 99 aa  47.8  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  31.82 
 
 		 424 aa  47.4  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  33.68 
 
 		 418 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  32.63 
 
 		 418 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  28.78 
 
 		 544 aa  47  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  35.07 
 
 		 472 aa  47  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  24.29 
 
 		 594 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  24.18 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  35.48 
 
 		 415 aa  44.7  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  34.82 
 
 		 467 aa  43.9  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  34.12 
 
 		 436 aa  43.9  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4808  O-antigen polymerase  36.99 
 
 		 391 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  28.98 
 
 		 438 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  25.69 
 
 		 594 aa  43.5  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  32.41 
 
 		 430 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>