More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0312 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 336 aa  684    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  37.61 
 
 		 292 aa  212  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  37.34 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  38.01 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  38.01 
 
 		 295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  38.01 
 
 		 295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  33.75 
 
 		 315 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  34.88 
 
 		 299 aa  169  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  33.44 
 
 		 321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  31.05 
 
 		 273 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  31.34 
 
 		 288 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  33.23 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 277 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 289 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  32.92 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 		 271 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  31.12 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  31.12 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  31.12 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  31.12 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  29.82 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  32.19 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  30.75 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  30.77 
 
 		 290 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  30.75 
 
 		 294 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 		 279 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2536  beta-ketoacyl synthase  67.01 
 
 		 522 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  30.67 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  30.46 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  27.88 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  30.79 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4622  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  73.49 
 
 		 277 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1024  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  74.07 
 
 		 3275 aa  109  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4003  hypothetical protein  74.67 
 
 		 100 aa  109  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313951  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  90.16 
 
 		 2200 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1283  transposase, IS4 family protein  83.1 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4204  hypothetical protein  64.29 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4615  hypothetical protein  98.18 
 
 		 112 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0565209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  91.53 
 
 		 514 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3586  hypothetical protein  77.63 
 
 		 104 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2545  hypothetical protein  94.55 
 
 		 514 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  26.06 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0193  hypothetical protein  96.43 
 
 		 121 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.092331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4746  hypothetical protein  71.6 
 
 		 173 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2000  hypothetical protein  91.38 
 
 		 167 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4441  hypothetical protein  92.86 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3276  hypothetical protein  65.26 
 
 		 172 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  29.88 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  26.4 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  27.08 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  27.08 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  55.65 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  26.25 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  26.95 
 
 		 300 aa  99.4  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  26.79 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 		 294 aa  99.4  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  25.17 
 
 		 300 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  25.78 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  26.33 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1699  hypothetical protein  90.91 
 
 		 105 aa  97.8  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4318  hypothetical protein  83.33 
 
 		 143 aa  97.4  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.385835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  25.56 
 
 		 295 aa  95.5  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  25.6 
 
 		 296 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  64.71 
 
 		 582 aa  93.6  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  24.21 
 
 		 299 aa  92.4  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2035  hypothetical protein  73.53 
 
 		 192 aa  89.4  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  25.93 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  24.52 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  27.65 
 
 		 302 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  26.73 
 
 		 295 aa  86.3  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 302 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  23.3 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  23.6 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  23.6 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  24.38 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  23.6 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  23.01 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0836  urate catabolism protein  24.63 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.391521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2758  chitin deacetylase  23.24 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.373365  normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  25 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  24.93 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  24.25 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  24.71 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  24.71 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  23.31 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  24.71 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  24.71 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1424  polysaccharide deacetylase  22.49 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.185486 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  23.81 
 
 		 317 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>