178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4746 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4746  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  348  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3253  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.03 
 
 
300 aa  120  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  100 
 
 
514 aa  115  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2545  hypothetical protein  96.49 
 
 
514 aa  114  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2536  beta-ketoacyl synthase  70.79 
 
 
522 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  77.92 
 
 
2200 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2000  hypothetical protein  63.27 
 
 
167 aa  110  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4622  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  94.74 
 
 
277 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1024  hypothetical protein  76 
 
 
172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4204  hypothetical protein  75 
 
 
394 aa  108  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460472  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0193  hypothetical protein  98.21 
 
 
121 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.092331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4441  hypothetical protein  78.87 
 
 
385 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  96.43 
 
 
3275 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2471  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.92 
 
 
300 aa  104  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  decreased coverage  0.00450242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  71.6 
 
 
336 aa  104  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1283  transposase, IS4 family protein  92.98 
 
 
304 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3586  hypothetical protein  96.36 
 
 
104 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  94.44 
 
 
305 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4003  hypothetical protein  70.73 
 
 
100 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313951  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3690  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  71.64 
 
 
297 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.781744  normal  0.0707419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3276  hypothetical protein  94.64 
 
 
172 aa  100  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2005  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.86 
 
 
295 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1699  hypothetical protein  91.07 
 
 
105 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1809  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.86 
 
 
295 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2035  hypothetical protein  58.04 
 
 
192 aa  99.4  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4615  hypothetical protein  94.44 
 
 
112 aa  98.6  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0565209  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2600  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.11 
 
 
299 aa  97.1  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00798756  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  54.72 
 
 
582 aa  95.5  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4318  hypothetical protein  86.21 
 
 
143 aa  94.4  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.385835  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3539  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.31 
 
 
299 aa  94.4  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.744262  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1530  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  59.38 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1500  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  59.38 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2851  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  59.38 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000128399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1494  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  59.38 
 
 
300 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1402  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  59.38 
 
 
300 aa  77  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2592  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57.81 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2659  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57.81 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0234954  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1343  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57.81 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.383496  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1380  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.94 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0240977 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2766  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57.81 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1938  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.25 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.46 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18140  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  59.38 
 
 
298 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1682  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.25 
 
 
300 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1478  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.12 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0583825  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.12 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.81552  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2778  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.12 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.104386  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1672  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.12 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.715505  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1087  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.04 
 
 
301 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27752  decreased coverage  0.00698053 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.12 
 
 
295 aa  68.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0853416  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3197  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.12 
 
 
305 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.800362  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3424  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.48 
 
 
296 aa  67.8  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0751599  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5647  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.77 
 
 
304 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373454  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3061  hypothetical protein  82.05 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.341918  normal  0.0301074 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0649  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  44.16 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0223  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.56 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1800  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  52.46 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1371  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57.41 
 
 
294 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.853218  normal  0.0694877 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4089  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.86 
 
 
297 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.24894 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3976  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.86 
 
 
297 aa  64.7  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5326  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.82 
 
 
299 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012022  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3407  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.82 
 
 
299 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4960  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.82 
 
 
299 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3659  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.82 
 
 
299 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2181  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.82 
 
 
298 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0921  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.82 
 
 
298 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0829  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.82 
 
 
298 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0717  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.18 
 
 
299 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396436  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1557  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.12 
 
 
298 aa  62.4  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.734948  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.12 
 
 
297 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0245  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  39.74 
 
 
298 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1525  hypothetical protein  93.94 
 
 
125 aa  62.4  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.56 
 
 
297 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.468786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4382  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  52.73 
 
 
300 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.128 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1790  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  57.58 
 
 
563 aa  61.6  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4901  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  52.73 
 
 
300 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0315002  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001550  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.45 
 
 
301 aa  60.8  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10700  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  52.73 
 
 
297 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.694075  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4259  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.91 
 
 
297 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.597  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01707  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.81 
 
 
312 aa  59.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.542283  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0763  hypothetical protein  66 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791123  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  100 
 
 
209 aa  59.3  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0363  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  59.3  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2997  hypothetical protein  90.62 
 
 
156 aa  58.9  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0932717  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0783  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.09 
 
 
296 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05487  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.94 
 
 
301 aa  58.2  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0951  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.44 
 
 
306 aa  57.8  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.012671  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2030  hypothetical protein  74.42 
 
 
109 aa  57.8  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0696  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.09 
 
 
295 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0467  hypothetical protein  75 
 
 
132 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2056  hypothetical protein  76.92 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2342  hypothetical protein  90.62 
 
 
99 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3511  hypothetical protein  76.92 
 
 
98 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325201  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1997  hypothetical protein  76.92 
 
 
79 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.570421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4666  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.27 
 
 
295 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534341  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0690  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.27 
 
 
295 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4530  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.27 
 
 
295 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0233897  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3787  hypothetical protein  76.92 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.564529  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4664  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.27 
 
 
295 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128162  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1094  hypothetical protein  46.91 
 
 
97 aa  55.8  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0968333 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>