100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0193 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0193  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  239  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.092331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4622  3-oxoacid CoA-transferase, A subunit  84.85 
 
 
277 aa  110  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2900  major facilitator transporter  90.32 
 
 
514 aa  110  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  0.0138886 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2536  beta-ketoacyl synthase  96.49 
 
 
522 aa  110  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
2200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2545  hypothetical protein  96.43 
 
 
514 aa  109  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239765  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4746  hypothetical protein  98.21 
 
 
173 aa  107  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4204  hypothetical protein  96.49 
 
 
394 aa  107  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460472  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  96.49 
 
 
3275 aa  107  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3586  hypothetical protein  93.1 
 
 
104 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.33976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1024  hypothetical protein  94.74 
 
 
172 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  96.43 
 
 
336 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2000  hypothetical protein  94.74 
 
 
167 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4615  hypothetical protein  63.44 
 
 
112 aa  103  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0565209  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1283  transposase, IS4 family protein  93.1 
 
 
304 aa  103  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.337005  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4441  hypothetical protein  91.23 
 
 
385 aa  103  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.150685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3276  hypothetical protein  93.1 
 
 
172 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4003  hypothetical protein  96.36 
 
 
100 aa  100  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.313951  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1699  hypothetical protein  94.55 
 
 
105 aa  100  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  75 
 
 
305 aa  98.6  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  85.96 
 
 
582 aa  96.3  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2035  hypothetical protein  75.34 
 
 
192 aa  96.3  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4318  hypothetical protein  81.97 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.385835  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4584  S-adenosylmethionine decarboxylase related protein  72.88 
 
 
154 aa  89  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5260  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  63.79 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0744  spermidine synthase  51.52 
 
 
431 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0026  S-adenosylmethionine decarboxylase related  50 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.479316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3061  hypothetical protein  88.89 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.341918  normal  0.0301074 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2883  S-adenosylmethionine decarboxylase related  39.39 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1525  hypothetical protein  96.88 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0763  hypothetical protein  78.05 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791123  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0092  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  96.88 
 
 
209 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1790  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  93.75 
 
 
563 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0258  hypothetical protein  49.25 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2997  hypothetical protein  90.91 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0932717  normal  0.548265 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2342  hypothetical protein  83.78 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3511  hypothetical protein  79.49 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0325201  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0467  hypothetical protein  79.49 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.956925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3787  hypothetical protein  72.73 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.564529  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2030  hypothetical protein  77.5 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.255552  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2056  hypothetical protein  76.92 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.232948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1997  hypothetical protein  79.49 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.570421 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1094  hypothetical protein  79.49 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0968333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0715  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  49.12 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0747  S-adenosylmethionine decarboxylase related  49.12 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1020  hypothetical protein  72.09 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0363  hypothetical protein  90.32 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.587808 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1701  hypothetical protein  72.5 
 
 
102 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3399  hypothetical protein  53.23 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355088  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4768  hypothetical protein  77.78 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1161  hypothetical protein  69.77 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4493  extracellular solute-binding protein  50 
 
 
577 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3614  hypothetical protein  51.47 
 
 
256 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0599096  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3462  hypothetical protein  51.56 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1330  hypothetical protein  79.31 
 
 
142 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24136  hitchhiker  0.00281182 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  53.33 
 
 
940 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4508  hypothetical protein  85.19 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.619373  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  51.67 
 
 
297 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1573  S-adenosylmethionine decarboxylase related  31.58 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0486  hypothetical protein  56.9 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4827  hypothetical protein  50 
 
 
382 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  53.33 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  46.05 
 
 
311 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1191  hypothetical protein  54.39 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0145  hypothetical protein  50 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2430  hypothetical protein  51.79 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.57 
 
 
312 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.551347  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  53.45 
 
 
814 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1350  hypothetical protein  54.39 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3301  hypothetical protein  55.36 
 
 
178 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  54.39 
 
 
220 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4462  hypothetical protein  51.67 
 
 
167 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00243841  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4861  imidazole glycerol phosphate synthase, glutamine amidotransferase subunit  52.46 
 
 
270 aa  43.9  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285943  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0272  S-adenosylmethionine decarboxylase related  36.36 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000023706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2362  hypothetical protein  43.68 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.409842  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  52.54 
 
 
1083 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  54.39 
 
 
766 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0788  extracellular solute-binding protein  52.73 
 
 
358 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00176914  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4550  hypothetical protein  54.39 
 
 
952 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2442  ABC transporter related  52.63 
 
 
634 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0403227  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2898  hypothetical protein  53.7 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0111524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0217  hypothetical protein  53.57 
 
 
387 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2843  hypothetical protein  50 
 
 
260 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00708177  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4444  hypothetical protein  90.48 
 
 
93 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.272849 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3581  hypothetical protein  51.79 
 
 
106 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0121712  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0506  hypothetical protein  53.57 
 
 
172 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  53.57 
 
 
281 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0862  hypothetical protein  51.79 
 
 
114 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0830  hypothetical protein  52.63 
 
 
383 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360573  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0406  hypothetical protein  52.63 
 
 
373 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0498  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  37.1 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  43.04 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3585  hypothetical protein  51.79 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0653  hypothetical protein  52.63 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  53.57 
 
 
202 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4187  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  50.88 
 
 
721 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.162597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2085  hypothetical protein  45.45 
 
 
82 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1826  adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  31.67 
 
 
122 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1087  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  31.67 
 
 
122 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4257  hypothetical protein  86.96 
 
 
80 aa  40  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.751318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>