More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4204 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4204  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  776    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  33.9 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  36.89 
 
 		 328 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  32.77 
 
 		 325 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  32.77 
 
 		 327 aa  197  3e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  32.28 
 
 		 331 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  32.28 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  34.45 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  36.23 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  35.07 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.06 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  32.58 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  32.58 
 
 		 330 aa  189  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  33.8 
 
 		 326 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  32.87 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  32.57 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  32.25 
 
 		 321 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  33.43 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  30.81 
 
 		 351 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  33.06 
 
 		 326 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  31.87 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  32.21 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  33.51 
 
 		 327 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  32.6 
 
 		 322 aa  186  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  33.02 
 
 		 330 aa  185  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  30.03 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  33.91 
 
 		 326 aa  184  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  35.71 
 
 		 356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  30.77 
 
 		 345 aa  183  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  31.73 
 
 		 304 aa  182  7e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  33.24 
 
 		 327 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  34.73 
 
 		 327 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  36.23 
 
 		 325 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  31.05 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  30.17 
 
 		 328 aa  180  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  33.05 
 
 		 330 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  34.81 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  31.29 
 
 		 328 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3683  twin-arginine translocation pathway signal  32.63 
 
 		 326 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0852906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  32.83 
 
 		 314 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  32.87 
 
 		 328 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  33.53 
 
 		 325 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  31.1 
 
 		 336 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  32.66 
 
 		 329 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  33.06 
 
 		 326 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  30.81 
 
 		 335 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  31.52 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5474  extra-cytoplasmic solute receptor  32.58 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.410144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  33.14 
 
 		 330 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  35.01 
 
 		 324 aa  177  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  32.95 
 
 		 325 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  28.19 
 
 		 325 aa  176  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  30.2 
 
 		 324 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  32.63 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  30.72 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  31.88 
 
 		 338 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  34.1 
 
 		 337 aa  175  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  32.65 
 
 		 349 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  30.59 
 
 		 346 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4611  hypothetical protein  30.86 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  31.91 
 
 		 328 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  30.11 
 
 		 335 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  33.72 
 
 		 325 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3056  hypothetical protein  33.23 
 
 		 332 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176831  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5153  extra-cytoplasmic solute receptor  30.75 
 
 		 329 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  30.75 
 
 		 331 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  32.55 
 
 		 323 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  31.32 
 
 		 326 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  34.86 
 
 		 328 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  28.85 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  31.44 
 
 		 330 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  30.22 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  32.76 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  30.21 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  31.4 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0579  hypothetical protein  29.25 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  30.66 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3841  hypothetical protein  32.07 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  29.91 
 
 		 325 aa  171  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  31.67 
 
 		 323 aa  171  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2584  hypothetical protein  34.82 
 
 		 337 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899321  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2588  hypothetical protein  32.02 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00507235  hitchhiker  0.00568903 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  29.26 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  31.37 
 
 		 333 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  33.97 
 
 		 333 aa  170  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  30.17 
 
 		 335 aa  170  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  32.95 
 
 		 333 aa  170  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  31.08 
 
 		 336 aa  169  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  32.13 
 
 		 320 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3530  hypothetical protein  29.62 
 
 		 331 aa  169  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175021  hitchhiker  0.00737093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  28.77 
 
 		 330 aa  169  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  30.86 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  29.84 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  30.43 
 
 		 339 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1141  hypothetical protein  30.26 
 
 		 322 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  30.66 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  30.83 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  30.92 
 
 		 325 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  34.76 
 
 		 341 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>