98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1691 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  100 
 
 		 512 aa  1030    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  36.64 
 
 		 502 aa  278  2e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  29.52 
 
 		 754 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  29.17 
 
 		 785 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  27.87 
 
 		 509 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  28.4 
 
 		 433 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  28.85 
 
 		 452 aa  101  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  27.07 
 
 		 470 aa  95.1  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  31.19 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  31.44 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  28.89 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  31.02 
 
 		 686 aa  70.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  31.02 
 
 		 686 aa  70.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1503  binding-protein-dependent transport system protein  28.65 
 
 		 501 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.200132  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  24.22 
 
 		 930 aa  65.1  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  27.84 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3039  putative binding-protein-dependent transport system protein  28.32 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3781  O-antigen polymerase  28.18 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  28.37 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  25.82 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1492  hypothetical protein  33.33 
 
 		 468 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  25.25 
 
 		 444 aa  55.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  26.65 
 
 		 457 aa  55.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  28.19 
 
 		 456 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  27.63 
 
 		 717 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  23.79 
 
 		 438 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  33.09 
 
 		 582 aa  53.5  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  27.21 
 
 		 413 aa  53.5  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3233  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  32 
 
 		 474 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  22.16 
 
 		 467 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  27.95 
 
 		 389 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  28.83 
 
 		 436 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3247  O-antigen polymerase  28.62 
 
 		 452 aa  52  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  25.21 
 
 		 668 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  29.49 
 
 		 773 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2985  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  29.32 
 
 		 474 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  26.81 
 
 		 457 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  26.81 
 
 		 457 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.83 
 
 		 501 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  27.36 
 
 		 429 aa  50.1  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  27.36 
 
 		 429 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  24.06 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  23.99 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  24.6 
 
 		 781 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  28.86 
 
 		 672 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  34.78 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 556 aa  49.3  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1584  O-antigen polymerase  27.49 
 
 		 463 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.791545  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  28.81 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  25.53 
 
 		 496 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2251  O-antigen polymerase  27.78 
 
 		 561 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.220671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  23.33 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  27.52 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0446  O-antigen polymerase  24.83 
 
 		 1070 aa  48.5  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  24.35 
 
 		 594 aa  48.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  26.7 
 
 		 426 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  33.33 
 
 		 425 aa  47.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2532  hypothetical protein  25.4 
 
 		 419 aa  47  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.786424  hitchhiker  0.000278522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  25.99 
 
 		 474 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  28.99 
 
 		 435 aa  47  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3885  O-antigen polymerase  30.23 
 
 		 443 aa  47  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.722344  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  40.32 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4235  O-antigen polymerase  33.8 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000407687  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  28.79 
 
 		 517 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  23.63 
 
 		 579 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  37.5 
 
 		 465 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  25.2 
 
 		 784 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  24.43 
 
 		 425 aa  46.6  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  23.48 
 
 		 594 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05350  O-antigen polymerase, Wzy protein  38.18 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00185086  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  25.14 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  27.03 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2523  O-antigen polymerase  24.55 
 
 		 738 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0830151  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  30 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  31.51 
 
 		 500 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  34.85 
 
 		 517 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1276  O-antigen polymerase  31.15 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000289141  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  33.63 
 
 		 516 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2461  O-antigen polymerase  28.81 
 
 		 580 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  34.67 
 
 		 454 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  23.11 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1029  putative O-antigen polymerase, putative membrane protein  25.88 
 
 		 455 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.384191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4985  O-antigen polymerase  30.16 
 
 		 391 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  34.48 
 
 		 531 aa  44.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  24.64 
 
 		 471 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1940  O-antigen polymerase  36.11 
 
 		 453 aa  44.3  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  25.5 
 
 		 671 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001320  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsG Lipid A core - O-antigen ligase  27.22 
 
 		 417 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  24.38 
 
 		 458 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2694  O-antigen polymerase  29.5 
 
 		 535 aa  44.3  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  31.11 
 
 		 443 aa  44.3  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  30.37 
 
 		 1025 aa  44.3  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  26.96 
 
 		 593 aa  43.9  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  28.5 
 
 		 497 aa  43.9  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  27.32 
 
 		 540 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1474  O-antigen polymerase  25.81 
 
 		 408 aa  43.5  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0679  O-antigen polymerase  31.34 
 
 		 437 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>