19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3233 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3233  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  100 
 
 		 474 aa  935    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2985  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  84.99 
 
 		 474 aa  788    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  32.03 
 
 		 472 aa  123  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1029  putative O-antigen polymerase, putative membrane protein  29.46 
 
 		 455 aa  87.8  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.384191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1492  hypothetical protein  31.27 
 
 		 468 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  27.79 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3781  O-antigen polymerase  26.86 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  32 
 
 		 512 aa  63.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  27.54 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  26.88 
 
 		 509 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  25.9 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1503  binding-protein-dependent transport system protein  26.45 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.200132  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4815  hypothetical protein  26.26 
 
 		 521 aa  55.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  27.95 
 
 		 452 aa  52  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  32.65 
 
 		 754 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  29.18 
 
 		 502 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  24.82 
 
 		 930 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  23.4 
 
 		 785 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  32.14 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>