39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4110 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  100 
 
 		 930 aa  1895    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  27.81 
 
 		 754 aa  99.4  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  26.82 
 
 		 433 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  24.76 
 
 		 509 aa  80.1  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  24.2 
 
 		 785 aa  77  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  25.26 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  25.66 
 
 		 502 aa  68.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  25.37 
 
 		 512 aa  68.6  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  33.61 
 
 		 781 aa  65.5  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  27.6 
 
 		 471 aa  63.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  27.03 
 
 		 457 aa  63.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  27.95 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  26.8 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  31.43 
 
 		 475 aa  57.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  26.36 
 
 		 457 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  26.36 
 
 		 457 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3039  putative binding-protein-dependent transport system protein  27.16 
 
 		 341 aa  53.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  24.84 
 
 		 773 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  30.53 
 
 		 737 aa  53.1  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  21.64 
 
 		 470 aa  52.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1584  O-antigen polymerase  24.85 
 
 		 463 aa  52.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.791545  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2985  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  32.86 
 
 		 474 aa  52  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  26.19 
 
 		 467 aa  52  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  22.42 
 
 		 438 aa  50.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  28.95 
 
 		 540 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  23.29 
 
 		 452 aa  48.9  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1492  hypothetical protein  24.55 
 
 		 468 aa  48.9  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  32.5 
 
 		 438 aa  48.9  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  23.18 
 
 		 686 aa  48.5  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  23.18 
 
 		 686 aa  48.5  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1503  binding-protein-dependent transport system protein  25.2 
 
 		 501 aa  47.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.200132  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  26.34 
 
 		 556 aa  47  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  25.23 
 
 		 517 aa  47  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3233  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  30.34 
 
 		 474 aa  45.8  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0690  hypothetical protein  28.1 
 
 		 458 aa  45.8  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  30.91 
 
 		 428 aa  45.8  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  24.71 
 
 		 582 aa  45.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6500  O-antigen polymerase  23.81 
 
 		 794 aa  45.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  27.89 
 
 		 441 aa  44.3  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>