20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6500 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6500  O-antigen polymerase  100 
 
 		 794 aa  1501    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  27.41 
 
 		 754 aa  82  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  28.4 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  25.62 
 
 		 785 aa  75.5  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  25.71 
 
 		 509 aa  67.4  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  25.06 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  32.63 
 
 		 531 aa  63.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3152  O-antigen polymerase  26.64 
 
 		 546 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  24.9 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2975  O-antigen polymerase  27.87 
 
 		 549 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.024758  decreased coverage  0.00000748304 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  26 
 
 		 438 aa  56.6  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  24.88 
 
 		 930 aa  55.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  25.07 
 
 		 502 aa  55.1  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  27.9 
 
 		 472 aa  52  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  22.49 
 
 		 470 aa  52  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  26.85 
 
 		 402 aa  50.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  23.39 
 
 		 737 aa  45.8  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  28.65 
 
 		 402 aa  45.1  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  32.31 
 
 		 605 aa  45.1  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2251  O-antigen polymerase  27.07 
 
 		 561 aa  44.7  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.220671  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>