37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02473 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  100 
 
 		 470 aa  949    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  47.54 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  36.34 
 
 		 438 aa  276  5e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  34.06 
 
 		 452 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  35.91 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  28.63 
 
 		 509 aa  170  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  24.9 
 
 		 754 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  27.32 
 
 		 512 aa  96.3  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  24.7 
 
 		 502 aa  90.5  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  26.06 
 
 		 472 aa  85.5  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  25.96 
 
 		 785 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2985  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  30.9 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3039  putative binding-protein-dependent transport system protein  25.11 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3233  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  27.75 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1503  binding-protein-dependent transport system protein  24.2 
 
 		 501 aa  58.9  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.200132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1029  putative O-antigen polymerase, putative membrane protein  29.08 
 
 		 455 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.384191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  34.42 
 
 		 832 aa  55.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517425 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3247  O-antigen polymerase  29.25 
 
 		 452 aa  55.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  27.21 
 
 		 930 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  23.91 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0657  O-antigen polymerase  41.57 
 
 		 588 aa  50.1  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0056678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  24.36 
 
 		 773 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  22.26 
 
 		 489 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3781  O-antigen polymerase  24.83 
 
 		 477 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1664  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 806 aa  47.4  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2494  O-antigen polymerase  24.66 
 
 		 563 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.754605 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  29.01 
 
 		 531 aa  46.6  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6500  O-antigen polymerase  25.56 
 
 		 794 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13891  hypothetical protein  24.61 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  21.88 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1492  hypothetical protein  24.35 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4092  O-antigen polymerase  25.73 
 
 		 415 aa  44.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  26.59 
 
 		 784 aa  44.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  22.12 
 
 		 428 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  23.7 
 
 		 496 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  34.19 
 
 		 506 aa  43.9  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05350  O-antigen polymerase, Wzy protein  32.26 
 
 		 467 aa  43.1  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00185086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>