21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2985 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3233  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  84.99 
 
 		 474 aa  788    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2985  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  100 
 
 		 474 aa  934    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  32.38 
 
 		 472 aa  120  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1029  putative O-antigen polymerase, putative membrane protein  29.12 
 
 		 455 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.384191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  29.46 
 
 		 433 aa  89.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1492  hypothetical protein  32.08 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3781  O-antigen polymerase  25.21 
 
 		 477 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  29.25 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4815  hypothetical protein  26.62 
 
 		 521 aa  67.4  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  27 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  30.9 
 
 		 470 aa  63.9  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1503  binding-protein-dependent transport system protein  26.11 
 
 		 501 aa  63.5  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.200132  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  28.35 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 754 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  30.8 
 
 		 512 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  25.85 
 
 		 930 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  29.38 
 
 		 502 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  30.57 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  24.78 
 
 		 785 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3039  putative binding-protein-dependent transport system protein  26.52 
 
 		 341 aa  43.9  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  24.58 
 
 		 737 aa  43.5  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>