20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1584 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1584  O-antigen polymerase  100 
 
 		 463 aa  908    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.791545  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4815  O-antigen polymerase  38.9 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.629862  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3247  O-antigen polymerase  32.81 
 
 		 452 aa  104  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1503  binding-protein-dependent transport system protein  29.4 
 
 		 501 aa  89.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.200132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  28.45 
 
 		 502 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  25.23 
 
 		 785 aa  65.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  25.85 
 
 		 930 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3039  putative binding-protein-dependent transport system protein  25.82 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  22.74 
 
 		 754 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  28.37 
 
 		 512 aa  57.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  28.37 
 
 		 457 aa  57  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3233  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  27.37 
 
 		 474 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  25.76 
 
 		 594 aa  53.1  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  25.58 
 
 		 561 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  26.45 
 
 		 597 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  23.31 
 
 		 773 aa  47  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  28.93 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2985  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  24.73 
 
 		 474 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  20.78 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0446  O-antigen polymerase  24.59 
 
 		 585 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>