64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_0822 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  76.53 
 
 
475 aa  697    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  100 
 
 
471 aa  939    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  57.14 
 
 
461 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  55.41 
 
 
470 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  59.16 
 
 
467 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  53.32 
 
 
457 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  53.32 
 
 
457 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  50.43 
 
 
467 aa  437  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  38.27 
 
 
438 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  39.72 
 
 
436 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  36.74 
 
 
438 aa  194  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  26.27 
 
 
781 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  30.45 
 
 
540 aa  90.5  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  24.15 
 
 
737 aa  83.6  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  23.6 
 
 
461 aa  81.3  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  26.39 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  24.24 
 
 
496 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  24.84 
 
 
532 aa  77  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  24.46 
 
 
436 aa  77  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  25.29 
 
 
492 aa  68.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  26.6 
 
 
773 aa  67.8  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  27.85 
 
 
930 aa  63.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  29.47 
 
 
468 aa  60.5  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  23.74 
 
 
393 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  22.37 
 
 
474 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  27.1 
 
 
458 aa  57.4  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  22.25 
 
 
413 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  24.21 
 
 
480 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  25.19 
 
 
438 aa  54.3  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  25.81 
 
 
754 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  26.94 
 
 
402 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  24.6 
 
 
503 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  21.17 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  24.42 
 
 
498 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  22.47 
 
 
459 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2975  O-antigen polymerase  26.57 
 
 
549 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.024758  decreased coverage  0.00000748304 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  27.87 
 
 
463 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  28.81 
 
 
440 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 
870 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  26.44 
 
 
454 aa  47.8  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3180  O-antigen polymerase  26.1 
 
 
498 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3152  O-antigen polymerase  25 
 
 
546 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2461  O-antigen polymerase  23.54 
 
 
580 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  23.55 
 
 
500 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  29.95 
 
 
443 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  26.63 
 
 
466 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  23.93 
 
 
504 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0446  O-antigen polymerase  23.24 
 
 
585 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  33.33 
 
 
464 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  23.74 
 
 
497 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  29.49 
 
 
443 aa  44.7  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  22.06 
 
 
501 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  26.47 
 
 
461 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  24.24 
 
 
495 aa  44.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  29.44 
 
 
594 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2346  O-antigen polymerase  26.32 
 
 
1009 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0470801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  20.51 
 
 
784 aa  43.9  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  24.43 
 
 
435 aa  43.9  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  24.73 
 
 
428 aa  43.5  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  25.47 
 
 
431 aa  43.5  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  25.13 
 
 
389 aa  43.5  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  25.78 
 
 
592 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  26.14 
 
 
592 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  26.14 
 
 
592 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>