73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2065 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  100 
 
 		 438 aa  854    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  62.01 
 
 		 436 aa  505  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  70.28 
 
 		 438 aa  504  1e-141  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  44.2 
 
 		 467 aa  264  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  42.71 
 
 		 467 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  37.15 
 
 		 470 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  39.71 
 
 		 457 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  39.71 
 
 		 457 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  36.14 
 
 		 461 aa  245  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  38.33 
 
 		 475 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  36.74 
 
 		 471 aa  226  9e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  28.22 
 
 		 781 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  30.22 
 
 		 474 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 540 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  27.37 
 
 		 496 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  32.45 
 
 		 754 aa  64.3  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  24.33 
 
 		 532 aa  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  27.8 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  27.61 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  31.36 
 
 		 454 aa  57  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  25.83 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  25.3 
 
 		 737 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  22.74 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  24.02 
 
 		 930 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  26 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  25.21 
 
 		 497 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.97 
 
 		 501 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  30.6 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  27.07 
 
 		 503 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  26.64 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  25.75 
 
 		 458 aa  50.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1186  Tetratricopeptide domain protein  26.32 
 
 		 829 aa  50.1  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0301041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  26.9 
 
 		 773 aa  50.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  25 
 
 		 461 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  25 
 
 		 504 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  29.03 
 
 		 531 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  22.81 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  26 
 
 		 565 aa  48.5  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  31.78 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  26.5 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2436  O-antigen polymerase  48.72 
 
 		 894 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  29 
 
 		 454 aa  47.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  28.22 
 
 		 436 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  32.43 
 
 		 443 aa  47  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  27.04 
 
 		 590 aa  47  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  27.44 
 
 		 437 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  30.13 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3180  O-antigen polymerase  28.53 
 
 		 498 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  31.33 
 
 		 503 aa  45.8  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  28.95 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  31.89 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  27.97 
 
 		 498 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  28.3 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0065  O-antigen polymerase  27.97 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  26.02 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  21.62 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  34.45 
 
 		 431 aa  44.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  25.62 
 
 		 578 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  29.03 
 
 		 468 aa  43.9  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18371  hypothetical protein  30.07 
 
 		 443 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  25.62 
 
 		 464 aa  44.3  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2975  O-antigen polymerase  27.47 
 
 		 549 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.024758  decreased coverage  0.00000748304 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2697  O-antigen polymerase  28.4 
 
 		 419 aa  43.9  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  27.04 
 
 		 404 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  27.04 
 
 		 404 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  26.62 
 
 		 504 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  24.2 
 
 		 433 aa  43.5  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  27.04 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  28.57 
 
 		 404 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  23.28 
 
 		 500 aa  43.5  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1775  hypothetical protein  30.05 
 
 		 713 aa  43.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  25.96 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  21.32 
 
 		 870 aa  43.1  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>