76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1822 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  100 
 
 
461 aa  907    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  39.63 
 
 
492 aa  277  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  37.64 
 
 
458 aa  266  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  34.11 
 
 
436 aa  214  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  28.25 
 
 
425 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2333  O-antigen polymerase  29.05 
 
 
431 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  27.73 
 
 
457 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  27.73 
 
 
457 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  25.39 
 
 
461 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  24.47 
 
 
532 aa  91.3  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  23.95 
 
 
475 aa  90.5  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  23.78 
 
 
470 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  24.16 
 
 
471 aa  87.4  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  23.02 
 
 
467 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  23.14 
 
 
467 aa  80.5  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  24.46 
 
 
781 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  22.55 
 
 
467 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  24.49 
 
 
459 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  28.19 
 
 
393 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  26.54 
 
 
612 aa  61.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  24.28 
 
 
501 aa  60.1  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  24.25 
 
 
540 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  23.23 
 
 
474 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  25.96 
 
 
498 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  24.4 
 
 
512 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  23.76 
 
 
773 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  22.74 
 
 
496 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  23.32 
 
 
504 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  22.66 
 
 
438 aa  53.5  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  25.28 
 
 
459 aa  53.5  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  22.89 
 
 
503 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1569  O-antigen polymerase  25.11 
 
 
489 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.497135 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  27.95 
 
 
425 aa  50.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2461  O-antigen polymerase  24.26 
 
 
580 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  26.41 
 
 
754 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0851  O-antigen polymerase  27.03 
 
 
469 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  23.64 
 
 
413 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  22.58 
 
 
428 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  23.41 
 
 
446 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  25.81 
 
 
468 aa  48.9  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  23.92 
 
 
737 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4465  O-antigen polymerase  28.46 
 
 
479 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000989096  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  21.94 
 
 
436 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  27.06 
 
 
408 aa  47.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  27.06 
 
 
408 aa  47.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  29.33 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  25.29 
 
 
443 aa  48.1  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  28.49 
 
 
433 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2510  hypothetical protein  24.06 
 
 
424 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27488  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  27.03 
 
 
433 aa  47.4  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  29.5 
 
 
607 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1208  O-antigen polymerase  26.47 
 
 
426 aa  47  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  22.54 
 
 
456 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  23.39 
 
 
717 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1310  hypothetical protein  28.65 
 
 
439 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3860  O-antigen polymerase  25.74 
 
 
494 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.182724  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5482  hypothetical protein  23.77 
 
 
545 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.406542  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  25.6 
 
 
592 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1436  O-antigen polymerase  26.88 
 
 
404 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  25.6 
 
 
592 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  25.6 
 
 
592 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3700  hypothetical protein  21.64 
 
 
480 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160795  normal  0.238064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  22.64 
 
 
500 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  22.31 
 
 
454 aa  45.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2854  hypothetical protein  25.98 
 
 
541 aa  44.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  21.15 
 
 
461 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  21.43 
 
 
438 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1241  hypothetical protein  27.03 
 
 
396 aa  44.7  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  25.64 
 
 
579 aa  44.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2697  O-antigen polymerase  26.97 
 
 
419 aa  43.9  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  28.65 
 
 
439 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.285408 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  30.3 
 
 
429 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  32.88 
 
 
426 aa  43.5  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5250  O-antigen polymerase  24.83 
 
 
336 aa  43.5  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  30.3 
 
 
429 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  28 
 
 
595 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>