18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2346 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2346  O-antigen polymerase  100 
 
 		 1009 aa  2052    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0470801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  24.4 
 
 		 735 aa  134  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  27.14 
 
 		 845 aa  120  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  23.23 
 
 		 784 aa  119  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  25.65 
 
 		 832 aa  115  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517425 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1664  O-antigen polymerase  31.22 
 
 		 806 aa  110  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4145  O-antigen polymerase  27.12 
 
 		 799 aa  104  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.373234  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1732  tetratricopeptide TPR_4  31.58 
 
 		 805 aa  79  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000559511  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2016  O-antigen polymerase  26.15 
 
 		 769 aa  76.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0271  O-antigen polymerase  29.25 
 
 		 760 aa  75.1  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2251  O-antigen polymerase  20.81 
 
 		 561 aa  67.4  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.220671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3138  O-antigen polymerase  24.88 
 
 		 761 aa  66.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  28.21 
 
 		 393 aa  46.2  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  29.21 
 
 		 503 aa  46.2  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  27.68 
 
 		 433 aa  45.4  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  29.6 
 
 		 475 aa  45.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  25.6 
 
 		 471 aa  45.1  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  25.66 
 
 		 540 aa  44.7  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>