21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1732 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1732  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 805 aa  1598    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000559511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4145  O-antigen polymerase  35.83 
 
 		 799 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.373234  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2016  O-antigen polymerase  38.93 
 
 		 769 aa  402  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3138  O-antigen polymerase  31.65 
 
 		 761 aa  343  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  32.67 
 
 		 832 aa  321  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517425 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1664  O-antigen polymerase  30.25 
 
 		 806 aa  225  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  27.13 
 
 		 845 aa  214  7e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  25.18 
 
 		 735 aa  174  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  24.82 
 
 		 784 aa  169  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2251  O-antigen polymerase  27.46 
 
 		 561 aa  101  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.220671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2346  O-antigen polymerase  22.47 
 
 		 1009 aa  91.3  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0470801  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  28.69 
 
 		 444 aa  50.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  31.08 
 
 		 489 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0257  O-antigen polymerase  34.38 
 
 		 419 aa  47.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  26.13 
 
 		 773 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  30.54 
 
 		 517 aa  46.2  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  29.53 
 
 		 754 aa  45.8  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  31.96 
 
 		 517 aa  44.7  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  29.52 
 
 		 425 aa  44.7  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  30.34 
 
 		 504 aa  44.3  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0161  O-antigen polymerase  30.92 
 
 		 440 aa  44.3  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971054  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>