54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3138 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3138  O-antigen polymerase  100 
 
 		 761 aa  1543    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4145  O-antigen polymerase  33.2 
 
 		 799 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.373234  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1732  tetratricopeptide TPR_4  30.92 
 
 		 805 aa  310  9e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000559511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  31.08 
 
 		 832 aa  297  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517425 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2016  O-antigen polymerase  31.85 
 
 		 769 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1664  O-antigen polymerase  23.74 
 
 		 806 aa  209  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  25.51 
 
 		 784 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  27.08 
 
 		 735 aa  171  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  23.77 
 
 		 845 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2346  O-antigen polymerase  24.88 
 
 		 1009 aa  99.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0470801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2251  O-antigen polymerase  25.43 
 
 		 561 aa  92.4  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.220671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0271  O-antigen polymerase  24.04 
 
 		 760 aa  87.4  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  30.46 
 
 		 471 aa  58.9  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 3035 aa  55.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  28.81 
 
 		 196 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  32.95 
 
 		 594 aa  53.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  32.03 
 
 		 754 aa  53.5  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  23.36 
 
 		 428 aa  50.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0257  O-antigen polymerase  28.26 
 
 		 419 aa  49.7  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  24.12 
 
 		 503 aa  49.7  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  30.4 
 
 		 544 aa  49.7  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 3560 aa  49.3  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  24.16 
 
 		 504 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  30.37 
 
 		 573 aa  48.5  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 329 aa  48.9  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 591 aa  48.5  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  21.68 
 
 		 612 aa  48.5  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.53 
 
 		 758 aa  48.1  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  32 
 
 		 573 aa  47.8  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13011  hypothetical protein  28.89 
 
 		 737 aa  47.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  30.95 
 
 		 489 aa  47.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  27.78 
 
 		 475 aa  47.8  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  30.12 
 
 		 745 aa  47  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 244 aa  47.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.62 
 
 		 2240 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  25.18 
 
 		 503 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  27 
 
 		 623 aa  46.6  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  26.14 
 
 		 438 aa  45.4  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 208 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 878 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 2262 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.46 
 
 		 643 aa  45.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 3145 aa  45.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0559  O-antigen polymerase  20.89 
 
 		 647 aa  44.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.024189  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0599  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.71 
 
 		 263 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  28.21 
 
 		 556 aa  44.7  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  23.33 
 
 		 594 aa  44.7  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  29.25 
 
 		 581 aa  44.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 187 aa  44.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  23.42 
 
 		 737 aa  44.7  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 209 aa  44.7  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 		 1737 aa  44.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 543 aa  44.3  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.04 
 
 		 410 aa  44.3  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>