19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1664 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1664  O-antigen polymerase  100 
 
 
806 aa  1598    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  31.8 
 
 
845 aa  310  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  29.57 
 
 
832 aa  241  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0517425 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4145  O-antigen polymerase  24.97 
 
 
799 aa  198  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.373234  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  25.89 
 
 
784 aa  198  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3138  O-antigen polymerase  23.99 
 
 
761 aa  183  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  26.09 
 
 
735 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2346  O-antigen polymerase  29.2 
 
 
1009 aa  108  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0470801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2251  O-antigen polymerase  26.11 
 
 
561 aa  105  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.220671  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1732  tetratricopeptide TPR_4  35.02 
 
 
805 aa  100  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000559511  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2016  O-antigen polymerase  33.07 
 
 
769 aa  99.4  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0271  O-antigen polymerase  26.03 
 
 
760 aa  69.3  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  31.71 
 
 
452 aa  52.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  26.35 
 
 
433 aa  50.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  32.4 
 
 
467 aa  49.3  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  30.17 
 
 
457 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  30.17 
 
 
457 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  27.01 
 
 
754 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0410  O-antigen polymerase  27.27 
 
 
552 aa  44.3  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>