27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2016 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_2016  O-antigen polymerase  100 
 
 		 769 aa  1528    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1732  tetratricopeptide TPR_4  38.93 
 
 		 805 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000559511  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4145  O-antigen polymerase  34.94 
 
 		 799 aa  349  9e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.373234  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  35.92 
 
 		 832 aa  331  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3138  O-antigen polymerase  31.47 
 
 		 761 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  29.74 
 
 		 845 aa  221  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1664  O-antigen polymerase  28.19 
 
 		 806 aa  220  7.999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  27.38 
 
 		 735 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  26.95 
 
 		 784 aa  155  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2346  O-antigen polymerase  24.4 
 
 		 1009 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0470801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2251  O-antigen polymerase  25.54 
 
 		 561 aa  86.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.220671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0271  O-antigen polymerase  24.78 
 
 		 760 aa  72.8  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  27.78 
 
 		 754 aa  55.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  22.62 
 
 		 612 aa  53.9  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 544 aa  51.6  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0257  O-antigen polymerase  41.79 
 
 		 419 aa  50.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  32.28 
 
 		 402 aa  50.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  30.63 
 
 		 436 aa  49.3  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  27.15 
 
 		 426 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  30.23 
 
 		 503 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 2262 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  23.03 
 
 		 495 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0648  hypothetical protein  27.67 
 
 		 462 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0799  O-antigen polymerase  30.65 
 
 		 465 aa  44.7  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00494175  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 432 aa  44.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  29.41 
 
 		 426 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  29.41 
 
 		 426 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>